医疗纠纷处理程序因选择的途径不同而不同，如选择申请卫生行政部门处理，则程序如下：
1、以书面形式申请卫生行政部门处理；
2、卫生行政部门收到申请十日内进行审查，决定是否受理；
3、如受理，必要时可以进行医疗技术鉴定；
4、依据鉴定结果，作出行政处理决定，进行赔偿调解。《
医疗事故处理条例》第三十七条规定，发生
医疗事故争议，当事人申请卫生行政部门处理的，应当提出书面申请。申请书应当载明申请人的基本情况、有关事实、具体请求及理由等。当事人自知道或者应当知道其身体健康受到损害之日起1年内，可以向卫生行政部门提出医疗事故争议处理申请。
法律依据
《医疗事故处理条例》第三十七条发生医疗事故争议，当事人申请卫生行政部门处理的，应当提出书面申请。申请书应当载明申请人的基本情况、有关事实、具体请求及理由等。当事人自知道或者应当知道其身体健康受到损害之日起1年内，可以向卫生行政部门提出医疗事故争议处理申请。
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