一、立案。程序与国土资源违法案件查处相同。
二、调查取证。承办人应与土地使用者取得联系，了解土地开发的情况及闲置原因，随同土地使用者进行现场勘察，制作《现场勘测笔录》和询问笔录，无法联系土地使用者的、经请示局领导同意后，登报告知。
三、认定性质。由承办人对调查情况进行初步认定，写出书面调查报告，提出闲置土地处置意见上报。
四、确定方案。由清闲领导小组对调查报告及处置意见在闲置土地例会上研究，根据不同情况最终确定土地处置方案。符合闲置土地确定条件的，发出《闲置土地确认通知书》，责令土地使用者提交有关资料登记核实。
五、依法报批。按照例会确定的处置方案，承办人填写《收回
土地使用权呈报单》或者《
土地闲置费征收呈报单》，上报市政府批准。
六、送达。承办人将《收回土地使用权决定书》或者《土地闲置费征收通知书》，送达当事人签收，如果无法与当事人联系，报经局领导批准后登报送达。程序与土地违法案件查处相同。
七、下达
处罚决定书。程序与土地违法案查处相同。办结土地闲置处理手续后，发出《延长土地建设期限的批复》，批准土地使用者延长土地建设期限。
八、注销
土地使用证。待诉讼期满后，执法队将案卷移交地籍部门办理土地使用证注销手续。
九、土地入库。地籍科办完注销手续后，入土地储备库，并由土地储备中心办理入库手续。
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