对单位犯罪自首的认定，需要把握以下三个方面的问题：
1、自动投案的实施者只能是其直接负责的主管人员或其他
直接责任人员，而不能是单位本身。既然《刑法》将上述人员的有关犯罪行为作为单位犯罪处理，其自动投案行为实质上也代表了单位。
2、必须如实交代单位的罪行。单位的罪行是所有涉案的直接负责的主管人员和其他直接责任人员的行为的综合体。因而投案者除了必须如实供述自己的犯罪行为外，还必须交代其所知道的所有其他人员的犯罪行为，否则不能从宽处罚。
3、关于单位意志的认定是单位自首之关键所在，它必须是单位整体意志的集中体现，即以单位的名义，且经过单位集体研究决定或者由其负责人员决定，如果单位内部在自首问题上有异议，适用少数服从多数原则来认定。
4、在认定单位犯罪自首时应注意，在判决书中应明确记载成立自首的是单位而非自动投案人员，以示区别。
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