一、侦查与审查起诉阶段分别由哪个司法机关处理?

分别由公安机关和检察院来处理，侦查是公安机关对相关案件的犯罪事实进行调查取证，审查起诉是人民检察院对公安机关移送起诉或免予起诉的案件，审查决定是否起诉的活动。审查起诉，是人民检察院在提起公诉阶段确定经侦查终结的刑事案件是否应当提起公诉，而对侦查机关确认的犯罪事实和证据、犯罪性质和罪名进行审查核实，并作出处理决定的一项诉讼活动。它是实现人民检察院公诉职能的一项最基本的准备工作，也是人民检察院对侦查活动实行法律监督的一项重要手段。因此，它对保证人民检察院正确地提起公诉，发现和纠正侦查活动中的违法行为，具有重要意义。

二、法律依据

《刑事诉讼法》第一百七十条规定：人民检察院审查案件，应当听取被害人意见。最高检《规则》第365条规定，对于无法直接听取被害人意见的，可以通知被害人提出书面意见，在指定期限内未提出意见的，应当记录在案。办案人员直接听取被害人的意见包括两个方面的内容：一是通过询问被害人进一步查清案件事实，核实其他证据;二是听取被害人关于案件处理的意见以及对惩罚犯罪的要求，告知被害人有权就因犯罪行为遭受的物质损害提起附带民事诉讼。

《刑事诉讼法》第一百六十九条规定：人民检察院对于侦查机关移送起诉的案件，应当在1个月以内作出决定，重大、复杂的案件，可以延长半个月。人民检察院审查起诉的案件，改变管辖的，从改变后的人民检察院收到案件之日起计算审查起诉期限。该条对审查起诉的期限以及改变管辖后审查起诉期限的计算，都作出了明确的规定。这一规定是长期审查起诉经验的总结，是符合准确、及时办案要求的。

《刑事诉讼法》第一百七十一条第3款的规定：对补充侦查的案件，补充侦查完毕移送人民检察院后，人民检察院也要重新计算审查起诉期限。以上规定的审查起诉的期限是针对犯罪嫌疑人被羁押的案件来说的，实践中对犯罪嫌疑人未被羁押的案件，人民检察院不受1个月至1个半月期限的限制，既可以在1个月至1个半月内完成，也可以超过这个期限，但是，必须贯彻迅速、及时原则，不得中断对案件的审查。

侦查和审查起诉都是司法审理过程中的相关程序，我国法律上对相关程序的认定是非常明确的，具体情况下应当严格按照法律规定的情况来进行处理，特别是对相关犯罪事实的认定上，应当首先进行侦查和调查取证，最后由检察机关来进行审查起诉并移送司法判决。