公司股东以出资为限对公司债务承担有限责任。破产清算的时候也只是清算公司的财产，不涉及公司股东非出资部分的个人财产。因为抵押合同属于债权债务合同的附合同，也就是说存在债权债务事实才会有抵押。如果是以家庭财产对公司出资了的话，那么这部分会纳入公司的破产财产，用于清偿;如果不是，不会被收回。而且如果您父亲不是公司股东，未以家庭财产出资，只是公司高管的话且未向公司借款的话，更加不会涉及到用家庭财产清偿了，之前签署的所谓抵押文件可能是无效的，因为不存在债权债务关系。

企业法人制度自产生至现在已有将近一千年的历史，但却从来没有出现过法人财产权问题的争论，或者说已经出现却没有引起人们的重视，法人财产权问题却引起了人们的广泛关注，并形成了一个旷日持久的社会性的大讨论。关于法人财产权的性质，我国法学界众说纷纭，莫衷一是，且对于法人财产权的性质的界定，往往与股权的性质联系起来，两项权利的构造具有某种统一性，股权的概念在法学上本来就争议很多，所以关于法人财产权与股权的界说显得更为复杂。

法人财产权具体包括：法人有接受全体投资人投资财产的权利(在法人设立之初也可以这样说，法人有哪些种类的财产权取决于投资人投资什么样的财产);法人有将接受的投资财产登记在法人名下的权利;有以法人的名义经营该财产的权利;有以接受的投资财产和法人的日后积累，既法人名下的全部财产承担法人民事责任的权利。所以说法人财产权是一种授权。进一步说是法定授权、定向授权、有限授权、特殊授权。或者说法人财产权是一揽子授权。授权的内容就是：投资人要将投资财产的占有权交付法人;接受投资的法人可以根据投资人授权将所接受的投资财产用于经营，无条件的用于承担法人自己的民事责任。