公司更名专利权人变更流程：1、当事人向国务院专利行政部门提交书面的申请材料，并附具变更理由的证明材料；2、提出变更专利权人的姓名等相关事项；3、国务院专利行政部门依法进行审查；4、核准变更。公司更名专利权人变更流程的法律依据

《中华人民共和国专利法实施细则》第一百一十九条

向国务院专利行政部门提交申请文件或者办理各种手续，应当由申请人、专利权人、其他利害关系人或者其代表人签字或者盖章；委托专利代理机构的，由专利代理机构盖章。

请求变更发明人姓名、专利申请人和专利权人的姓名或者名称、国籍和地址、专利代理机构的名称、地址和代理人姓名的，应当向国务院专利行政部门办理著录事项变更手续，并附具变更理由的证明材料。