种植药材的土地被占用，应当按省实施土地管理法办法的规定和县级人民政府的地上物补偿标准给予补偿。

政府征用农村土地，会向农户支付土地补偿费、安置费、青苗费和地上附着物补偿费等。其中中药材征地补偿标准应该是参考药材的市价，进行一定比例的折算，按照青苗费补偿。如果农民对征地补偿方案有异议，可以在公告阶段提出自己的主张，即便是到了实施阶段，也可以通过发起行政诉讼维权。

行政诉讼一审流程如下：

1、原告起诉，法院立案；

2、审理前准备：向被告送达起诉状副本；向原告送达收到的答辩状副本；通知当事人和诉讼参与人开庭时间、地点；

3、开庭审理：按原告、被告、第三人的顺序陈述行政争议；举证质证；辩论；当事人最后陈述等；

4、当庭判决或择日宣判，并向各方当事人送达判决文书。

【法律依据】

《中华人民共和国土地管理法》第四十七条，国家征收土地的，依照法定程序批准后，由县级以上地方人民政府予以公告并组织实施。

县级以上地方人民政府拟申请征收土地的，应当开展拟征收土地现状调查和社会稳定风险评估，并将征收范围、土地现状、征收目的、补偿标准、安置方式和社会保障等在拟征收土地所在的乡（镇）和村、村民小组范围内公告至少三十日，听取被征地的农村集体经济组织及其成员、村民委员会和其他利害关系人的意见。

多数被征地的农村集体经济组织成员认为征地补偿安置方案不符合法律、法规规定的，县级以上地方人民政府应当组织召开听证会，并根据法律、法规的规定和听证会情况修改方案。

拟征收土地的所有权人、使用权人应当在公告规定期限内，持不动产权属证明材料办理补偿登记。县级以上地方人民政府应当组织有关部门测算并落实有关费用，保证足额到位，与拟征收土地的所有权人、使用权人就补偿、安置等签订协议；个别确实难以达成协议的，应当在申请征收土地时如实说明。

相关前期工作完成后，县级以上地方人民政府方可申请征收土地。