违法条款协议通常无效，但合同仍然有效。根据法律规定：

1、一般双方协商一致后，合同变更后仍可完全生效；协商不一致的，只有违法条款无效；

2、违反国家安全或者泄露国家机密的，合同无效；

3、违法条款属于合同的八个主要条款之一，如当事人姓名住所、标的数量和质量；合同订立时，一方受到胁迫，在非自愿情况下签订合同，合同自始无效。

民间借贷违法条款

（一）套取金融机构贷款转贷的；

（二）以向其他营利法人借贷、向本单位职工集资，或者以向公众非法吸收存款等方式取得的资金转贷的；

（三）未依法取得放贷资格的出借人，以营利为目的向社会不特定对象提供借款的；

（四）出借人事先知道或者应当知道借款人借款用于违法犯罪活动仍然提供借款的；

（五）违反法律、行政法规强制性规定的；

（六）违背公序良俗的。

《中华人民共和国民法典》第一百五十三条违反法律、行政法规的强制性规定的民事法律行为无效。但是，该强制性规定不导致该民事法律行为无效的除外。

违背公序良俗的民事法律行为无效。

《中华人民共和国民法典》第一百五十六条民事法律行为部分无效，不影响其他部分效力的，其他部分仍然有效。