公司非法集资进行处罚的方式：一般情况下，判处罚金。且同时还应当对该公司的直接负责人或主管人员予以三年以下有期徒刑或者拘役，若情节严重的，处三年以上十年以下有期徒刑，情节特别严重的，处十年以上有期徒刑，并处罚金。

非法集资公司的高管会被判

非法集资公司的高管，如果并未参与非法集资，不会被判刑。以非法占有为目的，使用诈骗方法非法集资，数额较大的，或者非法吸收公众存款或者变相吸收公众存款，扰乱金融秩序的，属于非法集资。但是非法集资需要怀有主观故意实施了该行为。

《中华人民共和国刑法》第一百七十六条

非法吸收公众存款或者变相吸收公众存款，扰乱金融秩序的，处三年以下有期徒刑或者拘役，并处或者单处罚金；数额巨大或者有其他严重情节的，处三年以上十年以下有期徒刑，并处罚金；数额特别巨大或者有其他特别严重情节的，处十年以上有期徒刑，并处罚金。

单位犯前款罪的，对单位判处罚金，并对其直接负责的主管人员和其他直接责任人员，依照前款的规定处罚。

有前两款行为，在提起公诉前积极退赃退赔，减少损害结果发生的，可以从轻或者减轻处罚。