离婚农村自建房可以通过协商确定权属，协商不成的可以提起诉讼确定房屋所有权归属。

农村自建房属于尚未取得所有权或者尚未取得完全所有权的房屋，如果双方协议不成的，人民法院不宜判决房屋所有权的归属，应当根据实际情况判决由当事人使用。

一、遇到未取得产权证和挂靠证的房屋如何分割

如果双方对尚未取得产权证的房屋的归属没有争议，能够协商一致，人民法院可以对房屋所有权的归属做出判决。双方不能协商一致的情况下，法院不判决房屋所有权的归属，应当根据实际情况判决由当事人使用，然后告知当事人待房屋取得完全所有权后另行起诉。

二、房产证未办理能分割财产吗

房产证未办理的房子如果属于夫妻共同财产是可以进行分割的。法律规定是：离婚时双方对尚未取得所有权或者尚未取得完全所有权的房屋有争议且协商不成的，人民法院不宜判决房屋所有权的归属，应当根据实际情况判决由当事人使用。

三、离婚时购买的房屋还没交付有贷款的怎样判决房屋归属

离婚时双方对尚未取得所有权或者尚未取得完全所有权的房屋有争议且协商不成的，人民法院不宜直接判决房屋所有权的归属。各地法院一般对于未取得所有权的房屋在判决中不直接进行处理，先判决由一方使用，待取得房产证后，双方当事人可到法院另行起诉分割。