组织机构代码证不注销，质量技术监督部门予以警告，逾期会罚款。组织机构代码证依法终止后，要申请注销登记。根据我国相关法律规定，组织机构依法终止的，应当自注销之日起30日内，持有关部门核准的注销文件或者证明办理注销登记，并交回组织机构代码证书。组织机构未按照相关规定办理组织机构代码证申请、换证、补证、变更的，可以由质量技术监督部门予以警告并责令其限期改正；逾期未改正的，可以处1000元以下罚款。

组织机构代码证哪个部门办理

组织机构代码证在工商局办理。组织机构代码是国家质检总局根据国家标准编制，并赋予每一个机关、事业、企业单位、社会团体、民办非企业单位和其他机构颁发的全国范围内唯一的、终身不变的法定标识。覆盖所有单位，包括法人和非法人以及内设机构，是连接政府各职能部门之间的信息管理系统的桥梁和不可替代的信息传输纽带。目前已在工商、税务、银行、公安、财政、人事劳动、社会保险、统计、海关、外贸和交通等40余个部门广泛应用，已成为单位在进行社会交往、开展商务活动所必需的“身份证明”。

《国家质量监督检验检疫总局关于修改的决定》第二十一条组织机构依法终止的，应当自注销之日起30日内，持有关部门核准的注销文件或者证明办理注销登记，并交回组织机构代码证书。

《国家质量监督检验检疫总局关于修改的决定》第二十五条组织机构未按照本办法的规定办理组织机构代码证申请、换证、补证、变更的，可以由质量技术监督部门予以警告并责令其限期改正；逾期未改正的，可以处1000元以下罚款。