目前，我国商业银行所得税的缴纳方式主要有三种：一是由分支机构逐级纳税调整后由其总行集中缴纳，其他税种则由分支机构就地交纳，这也是各大商业银行基本上采用的方式；二是在年度中间由分支机构就地预缴，年度终了再由总行统一汇算清缴；三是由各地分支机构向地方自行缴纳所得税。这三种方式可以说是各有利弊，但是从纳税数额上来说，前两种方法更具优势。因为若某分支行某年度出现应纳税所得额为负的现象，在汇算清缴时可以抵消掉一部分应纳税所得额。对于营业税的缴纳也亦采用合并缴纳的方法，因为我国税法规定，同一大类不同品种金融商品买卖出现的正负差，在同一个纳税期内可以相抵，相抵后仍出现负差的，可结转下一个纳税期相抵，但年末时仍出现负差的，不得转入下一个会计年度。因此，在各个营业分支机构的营业额出现由正负差时，应合并缴纳营业税，这样可以得到节税的效果。