纳税人清包工税率是9％。纳税人以清包工方式提供的建筑服务，可以选择适用简易计税方法计税。以清包工方式提供建筑服务，是指施工方不采购建筑工程所需的材料或只采购辅助材料，并收取人工费、管理费或者其他费用的建筑服务。为甲供工程提供的建筑服务，可以选择适用简易计税方法计税。甲供工程，是指全部或部分设备、材料、动力由工程发包方自行采购的建筑工程。

小规模纳税人税率计算方法

增值税对小规模纳税人采用简易征收办法，对小规模纳税人适用的税率称为征收率。

考虑到小规模纳税人经营规模小，且会计核算不健全，难以按增值税税率计税和使用增值税专用抵扣进项税额，因此实行按销售额与征收率计算应纳税额的建议办法。自2014年7月1日起，小规模纳税人增值税征收率一律调整为3％。

小规模纳税人（除其他个人外）销售自己使用过的固定资产，减按2％征收率征收增值税。只能够开具普通发票，不得由税务机关代开增值税专用发票。

《中华人民共和国增值税暂行条例》第十三条小规模纳税人以外的纳税人应当向主管税务机关办理登记。具体登记办法由国务院税务主管部门制定。小规模纳税人会计核算健全，能够提供准确税务资料的，可以向主管税务机关办理登记，不作为小规模纳税人，依照本条例有关规定计算应纳税额。

《中华人民共和国增值税暂行条例》第一条在中华人民共和国境内销售货物或者加工、修理修配劳务（以下简称劳务），销售服务、无形资产、不动产以及进口货物的单位和个人，为增值税的纳税人，应当依照本条例缴纳增值。