建筑企业的征地拆迁补偿款能抵扣，但需要有真实、合法的凭证。搬迁企业购买或者建造与搬迁前性质、用途相同或者类似的固定资产和土地，进行技术改造或者安置职工的，搬迁企业的搬迁收入，可以扣除固定资产置换、技术改造、职工安置等费用，其差额计入企业应纳税额。

《中华人民共和国企业所得税法》第十一条

在计算应纳税所得额时，企业按照规定计算的固定资产折旧，准予扣除。

下列固定资产不得计算折旧扣除：

（一）房屋、建筑物以外未投入使用的固定资产；

（二）以经营租赁方式租入的固定资产；

（三）以融资租赁方式租出的固定资产；

（四）已足额提取折旧仍继续使用的固定资产；

（五）与经营活动无关的固定资产；

（六）单独估价作为固定资产入账的土地；

（七）其他不得计算折旧扣除的固定资产。