公司因员工诽谤造谣而将其开除是否合法要看公司规章制度的规定，如果公司的规章制度规定，造谣诽谤属于严重违法公司规章制度的行为的，则公司可以因此将其开除；反之公司规章制度没有这种规定的，公司因此将其开除则是不合法的。

《劳动合同法》第三十九条

劳动者有下列情形之一的，用人单位可以解除劳动合同：

（一）在试用期间被证明不符合录用条件的；

（二）严重违反用人单位的规章制度的；

（三）严重失职，营私舞弊，给用人单位造成重大损害的；

（四）劳动者同时与其他用人单位建立劳动关系，对完成本单位的工作任务造成严重影响，或者经用人单位提出，拒不改正的；

（五）因本法第二十六条第一款第一项规定的情形致使劳动合同无效的；

（六）被依法追究刑事责任的。