非婚生孩子抚养协议书双方签订完是否要公证由当事人自己决定，即使不公证也不影响抚养协议生效。

如果当事人决定要公证的，可以向住所地、经常居住地、行为地或者事实发生地的公证机构提出公证申请。公证后会使协议具有更高的效力。

《公证法》第二十五条

自然人、法人或者其他组织申请办理公证，可以向住所地、经常居住地、行为地或者事实发生地的公证机构提出。

申请办理涉及不动产的公证，应当向不动产所在地的公证机构提出；申请办理涉及不动产的委托、声明、赠与、遗嘱的公证，可以适用前款规定。