深圳一般纳税人公司注销税务登记流程：

一、填写注销申请表格

1、纳税人到办税服务厅填写《注销税务登记申请审批表》、《取消防伪税控资格申请审批表》、《企业所得税清算申报表》；

2、纳税人到税源管理部门领取填写《增值税一般纳税人注销登记传递卡》。

二、取消防伪税控资格

1、纳税人到办税服务厅上缴空白、作废专用发票；

2、申报期注销：正常抄税—正常报税—正常申报—正常缴款—税源管理部门审核批准《取消防伪税控资格申请审批表》—税政法规股做审批《取消防伪税控资格申请审批表》—到信息中心授权修改金税卡时钟－－在开票系统将金税卡时钟修改为次月的1日－－再次抄税－－到办税服务厅办理注销报税—到信息中心上缴金税卡、IC卡－－注销月份增值税申报、缴款（若申报期已开具发票）；

3、非申报期注销：税源管理部门审批《取消防伪税控资格申请审批表》－－税政法规股审批《取消防伪税控资格申请审批表》－－到信息中心授权修改金税卡时钟－－在开票系统将金税卡时钟修改为次月的1日－－再次抄税－－到办税服务厅办理注销报税－－到信息中心上缴金税卡、IC卡—注销月份增值税申报、缴款。

三、取消公司一般纳税人资格（若公司是注销登记则可跳过此环节）

1、办税服务厅受理《取消增值税一般纳税人资格审批表》

四、注销税务登记

1、纳税人办理企业所得税年度申报、缴款；

2、税务部门开展税务注销检查（一般纳税人是由纳税评估科负责检查、小规模纳税人由管理部门进行检查、在查案件由稽查局负责检查）；

3、办税服务厅清缴注销检查环节产生的税款；

4、纳税人填报《企业所得税清算申报表》；

5、办税服务厅清缴清算所得税额；

6、税源管理部门收缴证件；

7、征收管理股在《注销税务登记申请审批表》上作注销审批；

8、办税服务厅根据注销审批意见注销税务登记。