一、建筑工程补充协议付款方式

1、直接支付至承包人的指定账户；

2、支付给承包人的有关人员；

3、支付给特定的第三方；

4、支付给约定的第三方；

5、支付给法定的第三方；

6、支付给基于其他因素确定的第三方；

7、以房屋抵偿。

二、工程款支付流程

1、工程价款是指建筑企业因承包工程项目，按合同规定和工程结算办法的规定，将已完工程或竣工工程向发包单位办理结算而取得的价款；

2、工程进度款是指造价审计核定后，经甲方确认已施工完毕的工程量，按照合同约定的比例及计价标刚才提到工程价款包含的是合同价和追加的部分，而追加部分主要就是由工程变更引起需要另行支付施工单位的款项了；

3、工程变更是在工程施工过程中可能会发生的款项，可能会作为工程进度款、工程结算款进行支付；

4、在工程竣工验收等程序履行完毕后，建设项目在竣工结算阶段，由施工单位提起竣工结算书后，经建设单位委托至造价审计审定，建设单位确认无误后支付乙方竣工结算款项。

三、工程进度款支付流程

1、施工单位先向工程部提交进度款《工程款支付申请表》，要求附上已完工程的预算书，一式叁份（工程部、预算办、财务部各一份），施工单位项目经理要签字；

2、工程部审核当月完成的部位及项目及相关工程量，审核完毕由工程部经理签字后交到预算专员；

3、预算专员审核已完成工程量，并审核工程预算价，确定当月完成工程造价，根据合同约定，审批工程款，然后预算专员签字确认。（注：预算办要求提供电子版预算书时，施工单位要积极配合）。