你这个属于交通事故，同时，也属于工伤。事故发生之后，如果单位没有给你报工伤的话，已经过了申报期限，如果报了工伤，你在拿到交通事故赔偿的同时，还可以拿到工伤的赔偿款。此类事故，通常要通过法院诉讼的程序来处理，医疗费用主要由死机和车辆的保险公司承担，你公司垫付的医疗费用，如果报了工伤的，可以到劳动局去报销，如果没有报工伤的，这只是垫付，到时根据法院判决书由司机和保险公司返还。交通事故的处理与工伤赔偿没有先后顺序，是不相干的两个法律程序，鉴于你的这种情况，按照正常的操作，要把工伤认定先申报的，不然就过期了。误工费也有由法院判决的，主要是由保险公司支付的。你的这个情况，要先进行司法鉴定，根据司法鉴定报告先司机和保险公司索赔，通常包括医疗费、误工费、护理费、营养费、住院伙食补助费、交通费、残疾赔偿金、精神损害赔偿等。
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工伤赔偿和交通事故赔偿在不重复的项目中没有冲突；但是对于重复性的赔偿项目，例如医疗费等，如果交通事故中的第三人已经支付侵权赔偿的，工伤赔偿基金和用人单位不再重复性支付。
事故责任的大小可以决定是否承担赔偿责任以及承担赔偿责任的比例大小。 但责任认定并不必然等同于赔偿比例，赔偿比例因交通事故的肇事方不同而有所区别。一种是机动车，一种是非机动车和行人。 相对来说，机动车和非机动车、行人发生交通事故，机动车承担的责任要多，这是立法时考虑到非机动车、行人属弱势群体，在赔付问题上给予的一种照顾。
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