按照新政策发证。 根据《关于农村集体土地确权登记发证的若干意见》第七点内容，按照不同的历史阶段对超面积的宅基地进行确权登记发证： 1982年《村镇建房用地管理条例》实施前，农村村民建房占用的宅基地，在《村镇建房用地管理条例》实施后至今未扩大用地面积的，可以按现有实际使用面积进行确权登记； 1982年《村镇建房用地管理条例》实施起至1987年《土地管理法》实施时止，农村村民建房占用的宅基地，超过当地规定的面积标准的，超过部分按当时国家和地方有关规定处理后，可以按实际使用面积进行确权登记； 1987年《土地管理法》实施后，农村村民建房占用的宅基地，超过当地规定的面积标准的，按照实际批准面积进行确权登记。其面积超过各地规定标准的，可在土地登记簿和土地权利证书记事栏内注明超过标准的面积，待以后分户建房或现有房屋拆迁、改建、翻建、政府依法实施规划重新建设时，按有关规定作出处理，并按照各地规定的面积标准重新进行确权登记。
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农村房子翻建超出面积后，其超出审批面积部分无法获得产权证、土地使用权证，建房者要主动向审批机关报告并按照规定补交费用。建房者也可在土地登记本和土地权利证书记事栏内注明超过标准的面积，等分户建房或房屋拆迁、改建、翻建、政府依法实施规划重新建设时，按规定面积标准重新确定使用权，超过部分退还集体。
农村建房超出面积的，按照超出面积的数量进行罚款。对于农村建房面积超出20平方米以下的部分，一般不会罚款。如果超出面积过多的，除了罚款外，还有可能将建筑中超出面积的部分拆除。
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