1、只要符合立案条件均应该立案，如果不予立案，法院应当出具不予受理通知书。2、当地法院的说法是错误的，能否立案不是看分居时间的长短。第一百零八条起诉必须符合下列条件：（一）原告是与本案有直接利害关系的公民、法人和其他组织；（二）有明确的被告；（三）有具体的诉讼请求和事实、理由；（四）属于人民法院受理民事诉讼的范围和受诉人民法院管辖。
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可以，但你要有证据证明，通常分居证据是很难认定的。而且必须是因感情不和分居两年才构成法定应当判离的理由。如果没有达到法定应当判离的条件，第一次起诉离婚通常不会判离，第二次起诉离婚一般都会判决离婚。但如果你确定要离婚的话，必须启动第一次诉讼离婚。当然你们也可以直接到当地民政局协议离婚即可。
分居两年后起诉，如果当事人有证据证明夫妻感情确已经破裂，因感情不和分居满二年；一方重婚或者与他人同居；实施家庭暴力或者虐待、遗弃家庭成员；有赌博、吸毒等恶习屡教不改等情形的，人民法院一般会判决准予离婚。
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