《财政部国家税务总局关于基本养老保险费基本医疗保险费失业保险费住房公积金有关个人所得税政策的通知》（财税〔2006〕10号）第二条规定：“根据《住房公积金管理条例》、《建设部、财政部、中国人民银行关于住房公积金管理若干具体问题的指导意见》（建金管〔2005〕5号）等规定精神，单位和个人分别在不超过职工本人上一年度月平均工资12%的幅度内，其实际缴存的住房公积金，允许在个人应纳税所得额中扣除。单位和职工个人缴存住房公积金的月平均工资不得超过职工工作地所在设区城市上一年度职工月平均工资的3倍，具体标准按照各地有关规定执行。单位和个人超过上述规定比例和标准缴付的住房公积金，应将超过部分并入个人当期的工资、薪金收入，计征个人所得税。”
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税前扣除的比例是12%以下，越过12%的部分，要计完个税之后才可以缴存。住房公积金在个人所得税税前扣除标准是不超过职工本人上一年度月平均工资12%的幅度内，其实际缴存的住房公积金，允许在个人应纳税所得额中扣除。
住房公积金贷款是可以抵扣个人所得税的。但是仅限于纳税人的首套住房贷款发生的利息支出，所有纳税人都只能享受一次首套住房贷款的利息扣除。住房贷款利息是按照每月1000元的标准定额扣除的，扣除期限最长不能超过240个月。
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