夫妻分居孩子的抚养权的归属问题，我国法律规定如下：一、关于两周岁以下子女的抚养 1、一般随母方生活。 2、母方有下列情形之一的，可随父方生活： （1）患有久治不愈的传染性疾病或其他严重疾病，子女不宜与其共同生活的； （2）有抚养条件不尽抚养义务，而父方要求子女随其生活的； （3）因其他原因，子女确无法随母方生活的。 3、父母双方协议随父方生活，并对子女健康成长无不利影响，可随父方生活。 二、关于两周岁以上的未成年子女的抚养 （一）父母双方争夺抚养权的 1、父方和母方均要求随其生活，一方有下列情形之一的，可予优先考虑： （1）已做绝育手术或因其他原因丧失生育能力的； （2）子女随其生活时间较长，改变生活环境对子女健康成长明显不利的； （3）无其他子女，而另一方有其他子女的； （4）子女随其生活，对子女成长有利，而另一方患有久治不愈的传染性疾病或其他严重疾病，或者有其他不利于子女身心健康的情形，不宜与子女共同生活的。 2、父方与母方抚养子女的条件基本相同，双方均要求子女与其共同生活，但子女单独随祖父母或外祖父母共同生活多年，且祖父母或外祖父母要求并且有能力帮助子女照顾孙子女或外孙子女的，可作为子女随父或母生活的优先条件予以考虑。 3、父母双方对十周岁以上的未成年子女随父或随母生活发生争执的，应考虑该子女的意见。 4、在有利于保护子女利益的前提下，父母双方协议轮流抚养子女的，可行准许。 （二）父母双方均拒绝抚养子女的 在离婚诉讼期间，可先行裁定暂由一方抚养。
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夫妻分居期间，孩子抚养费应该由孩子的父母双方来承担。因为抚养子女是父母的法定义务，无论父母是分居还是离婚了，都要承担抚养的义务和职责，父母不履行抚养义务的，未成年子女或者不能独立生活的成年子女，有要求父母给付抚养费的权利。
离婚后双方都有权抚养子女，离婚后，哺乳期内的子女，以随哺乳的母亲抚养为原则。哺乳期后的子女，如双方因抚养问题发生争执不能达成协议时，由人民法院根据子女的权益和双方的具体情况判决。
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