辞职后公司最后一个月工资中社会保险会代扣到你社会在本企业的中止日期，如果没有中止交费则须代扣个人应缴纳的部分。 用人单位代扣代缴社保是公司提法定义务与责任，用人建立了社保关系则要按规定交缴纳个人应缴部分，否则会造成断交费问题，与劳动者是不利的。 同时，社保缴费都是公司缴费（大部分）＋个人缴费（小部分）来构成，从情理法理上最后一个月工资都应扣个人应缴费部分。在解除劳动合同关系时公司应出具解除合同证明给你，写明你的社保缴纳基本情况，截至月份等。
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补交社会保险费用是社会保险法的规定。根据《社会保险法》的规定，用人单位未缴纳社会保险的，由社保局责令其限期补缴。用人单位补交的，只需要补交其应当负担的部分，个人负担部分，由劳动者负责补交。劳动合同除前款规定的必备条款外，用人单位与劳动者可以约定试用期、培训、保守秘密、补充保险和福利待遇等其他事项。另可依据《中华人民共和国社会保险法》、《中华人民共和国劳动争议仲裁调解法》，具体可向地人力资源和社会保障局劳动仲裁部门申诉。
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