当发生医疗事故争议时，医患双方当事人均可以向卫生行政部门提出处理申请。医方提出申请的可以是医疗机构，也可以是相关医务人员，患方提出申请的应为患者本人，如患者死亡的，应为死者近亲属。当事人应以局面形式向卫生行政部门提出处理申请。因为医疗事故行政处理是一个严肃的依法行政过程，关系到医患双方的合法权益，必须有一个严谨的、科学的、客观的、有效的形式和程序;其次，当事人以书面形式提出申请可以更准确、更详细、更全面反映医疗过程和自己的意愿;第三，当事人以书面形式提出申请可以存档备查，有利于妥善处理医疗事故争议。
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医疗事故的处理方式可以分为三种；医患双方自行协商解决；卫生行政部门介入处理，在医疗事故发生后，当事人可申请卫生行政部门处理；直接向人民法院提起民事诉讼。
医疗事故处理办法有：双方协商、调解、法院判决。发生医疗事故后，患方可以先和院方本着平等自愿的原则，在充分协商的基础上达成和解协议，和解协议在当事人双方之间产生约束力。如果和解不成的，当事人可以请求卫生行政部门调解，或者请求法院依法做出判决。
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